7月2日，在将耐克的广告处理完毕后，方剑辉离开了日本，直飞台岛台北市。
这次来台岛，方剑辉的目的就是拍摄《那些年，我们一起追的女孩》。本片的出品方是台岛的方氏姐妹影业公司，制片人是林清霞，监制是张爱嘉，副导演是陈佳上。
此前，《那些年》剧组早就成立，并已进行了大量的前期准备工作。
电影的拍摄场地选在台北77中学，这是一所私立中学，教育教学设施都比较先进。
一般来讲，这样的学校是不让拍摄的，给钱都不行。因为哪怕是周末，都会有一些辅导班什么的在开课，但方剑辉的名头起了作用，一听说是方剑辉自导自演，校长立马答应了拍摄要求，还主动选拔了一些学生作为群众演员来配合。
学生们听说方剑辉会来本校拍戏，同样是兴奋异常，对于临时演员名额的争夺是相当激烈。
除了男女主角，片中男主的几位死党和女主好友的人选，也颇费了一番工夫。最后，男主四位死党分别由来自台岛的焦恩军（曹国胜OR老曹）、马金涛（许博淳OR勃起）、度宗华（廖英宏OR该边）、林同（阿和OR胖子）饰演，女主的好友胡家玮OR弯弯找了几个都不合适，监制张爱嘉自告奋勇，请缨出演。
说实在的，由张爱嘉这样功成名就的女演员来给籍籍无名的王祖贤搭戏，方剑辉还是有些过意不去的，不过张爱嘉并不介意，他也就由她了。
7月4日，剧组正式开机（呼，王祖贤松了一口气，作者君，大半年了，终于想起来让我出场了吗？）。
“我和小贤的座椅要调整一下，太高了。”
一开拍，方剑辉就发现问题了。方剑辉脸嫩，尽管已经23岁，但是演一个高中生还是完全没问题的；而王祖贤不过17岁，本就处于学生时代，更不成问题。但是，对于高中生来说，他和王祖贤的个子都太高了。
方剑辉超过1米8的身高，王祖贤也是1米72，两人往教室一坐，明显比其它同学高出一大截。发现问题后，道具组立刻动手，将两人的凳子削短了一截，看起来终于协调多了。
“第22场，第3镜，第1次，开始！”副导演陈佳上大声喊道。
时间：白天，地点：教室，人物：英文老师、方辉、沈佳宜、阿和等人
旁白：那一天，英文老师不晓得是股票输钱还是月经乱掉，整张脸跟大便一样臭，散发出比平常更重的杀气。
上课铃响，大家都在拿课本。急促的高跟鞋声逼近（镜头贴地），脸色不善的英文老师走进教室。
班长：起立！
英文老师：坐下！上课！
沈佳宜在书包里遍寻不着课本，非常焦急。方辉注意到沈佳宜的窘态，嘴角微微上扬。
英文老师：打开第五十三页。
旁白：原本我以为，如果有一天能看到品学兼优的沈佳宜出糗，一定是上学最大的乐趣。我说，原本。
沈佳宜越来越焦急，方辉的表情变得有点迟疑。
英文老师：没带课本的站起来！
方辉：……（若无其事地将课本拿到沈的桌上，然后站起来）
（沈佳宜的面前突然多了课本，柯腾顺着沈佳宜的抬头而站了起来。）
英文老师：方辉，学期都过了三分之一，每天都要用的英文课本还是不带，到底有没有心上课啊？椅子！
柯腾：……（默默举起椅子）
英文老师：知不知道私立学校的学费很贵？你连最基本的课本都没带，你来学校干嘛的？来吃便当的啊？
沈佳宜：（异常紧张）
阿和：（看着沈佳宜）
方辉：……便当是一定要吃的啊。
英文老师：还蛮会开玩笑的嘛？有没有羞耻心啊！
方辉：……
英文老师：手举举高一点，再高一点！没吃饭是不是？去走廊跳十圈再进来。谁叫你手放下来？椅子！
“咔！”
方剑辉看了回放，点了点头：“过了！”
在整个剧组中，以王组贤为最大的短板，其余人员的演技都是达标的。可以说，一场戏拍的顺不顺利，速度快不快，大半取决于她。
好在，本片演的就是中学时代，王组贤只需本色出演即可，大大降低了对她的演技要求，而且，从她拿到剧本起，时间已经过去大半年，有方剑辉不时的耐心指导，她对于影片已经有了很好的理解。是以，一些难度不太高的场景，拍起来还是挺顺利的。
“第23场，第1镜，第1次，开始！”
时间：白天，场景：教室走廊，教室，人物：方辉，沈佳宜
（注意，此场有一个镜头用于事后回忆。）
方辉在走廊一边举椅子，一边青蛙跳，表情艰辛，汗流浃背。
课堂上，全班集体朗诵着课文。
沈佳宜紧握着笔，看着方辉的英文课本。
方辉的英文课本上都是涂鸦，上头有一句话用原子笔写着：沈佳宜如果不要那么假正经，其实还蛮可爱的。
沈佳宜露出有一点开心的微笑。
“咔！”
为了让王组贤的感情紧随着电影剧情走，避免混乱的时间线让她不知所措，方剑辉特意将有关王组贤的镜头全按电影的实际顺序拍摄。
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不到十天的工夫，中学阶段的场景眼看就要全部完结了，今天拍摄的是毕业典礼的场景。
这个场景涉及的人物众多，在学校配合下，剧组召集了77中学高三的全体中学，齐集学校礼堂，作为场景中的背景帝。
“第51场，第2镜，第3次，开始！”
时间：白天，场景：典礼会场，人物：全校毕业生
（此处应有配乐）--方剑辉为本片特意创作了多首歌曲，此处的配乐是他写的《萍聚》，将由邓丽筠演唱。
唱着歌，全校毕业生齐聚一堂。
许多人嚎啕大哭，或偷偷拭泪。
弯弯哭得很崩溃的特写。该边帮弯弯擦眼泪，被弯弯挥手拍掉。
许多同学都忙着在彼此的衣服上签名，或互相别花针，互相拥抱，不只一个人捧着花，大家互相在毕业纪念册上留言。
大家轮流用麦克笔在彼此的制服上签名。老曹在勃起的衣服上写着大大的“手枪王”三个字。
老曹：（用手钩住勃起的脖子）上大学不要那么常打手枪，乖。
阿和：他又不见得考得上大学。
勃起：妈啦。
方辉在勃起的额头上写了个“赛”字。
方辉：每天都要记得大便喔。
沈佳宜代表毕业生致词。
沈佳宜：六年前，刚刚踏进精诚中学国中部的时候，十二岁的我们懵懵懂懂，虽然对未来有无限的想像，却不晓得会在这里学习到什么、收获到什么，幸好一路上有师长的谆谆教诲，同学间也培养了深厚的情谊，一起经历了困难挫折，也一起携手成长。我说，77中学就是我们的青春，也是最美好的行囊，毕业典礼后，就让我们用力张开翅膀，飞向各自不同的梦想！各位同学，我们珍重再见！
“咔！”
方剑辉鼓掌上前，轻轻抱住王组贤：“小贤，太棒了，你怎么想到在致辞时带着泪花的？效果真是出奇的好啊！”
大庭广众的，王组贤还是有点羞涩：“也不是专门想的。就是说这一段的时候，想到自己以后真的离开学校了，有感而发罢了。”
“很好，都学会体验式表演了！”对于王组贤取得每一点进步，方剑辉都毫不吝惜表扬。