当身在拉斯维加斯的凌波一切准备就位时并没有想到就在几个小时之前，他们之前认为没有留下一丝痕迹的日本行动出现了问题。
井上明从办公室出来之后经过短暂的情绪稳定和思绪整理之后，便快步来到了警视厅的交通管理中心。井上明问着交通管理中心的主任“这里的监控录像还需要多久可以恢复”，“恐怕有些难度，录像文件不是简单的删除，如果是简单删除，我们很快就可以恢复所有文件，这次的录像文件所在磁盘位置被反复读写，这样困难很大，就算恢复一部分文件，我们可能得到的是支离破碎的画面”管制中心的信息主管小心翼翼的解释着问题，他知道他得罪不了眼前这个男人。
“入侵系统真的没有留下一丝痕迹吗？”井上明这么问并不是没有理由的，警视厅有着价值五十万美金的网络安全系统，在这个网络入侵技术如此先进的今天，没有什么系统是万无一失的，但是想要没有留下一丝痕迹这是相当困难甚至有些不可能。“我们检查了警视厅所有外部连接的系统日志，的确没有发现可疑连接”这也是主管郁闷并且担心的事情，因为如果确实发现安全系统出现问题那么自己的责任就要小很多；这时候的井上也在思考，突然刚才主管说的话中一个词引起了他的注意，井上马上说道“你马上检查系统所有的工作日志！尤其是内部系统文件交换日志”。
信息主管一下子蒙了，内部文件交换是最平常不过的记录了，而且很显然眼前的这位特殊部门的调查人员开始对自己内部产生怀疑，但是主管还是拨了一通内部电话，要求梳理全部日志，这时的主管只能默默祈求一切平安无事了，但是这样的祈祷并没有带来主管想要的结果，五分钟后一份资料送了过来，但是结果却出乎了主管的意料，但是却和井上明之前想的一样，资料显示病毒首先发作的那台计算机位于交通管制中心，而且病毒存入时间也和女武神被窃的时间相差一天，这绝对不是巧合。
“马上根据文件存入时间查看当时警视厅所有内部监控录像”井上兴奋了，他终于找到一个线索了，剩下的事情就是顺着这个线索找到让自己蒙羞的人。很快杨阳和姚明的身影便出现在井上眼前，并且经过和内部人员的相貌对比之后，一切都明了了。这时的井上就像嗅到鲜血的鲨鱼，内心已经极度兴奋了。
在日本内阁情报调查室工作这么多年的井上明知道自己已经成功一半了，他一边将两人照片发送回内阁情报调查室，一边拿着打印出来的照片来到案发现场开始更详尽的调查，当走访好几家路边店铺没有线索之后，井上终于在事故当天二号车所在的路口对面，也就是日本银行支行的监控录像里面找到了他梦寐以求的东西，在银行外部的摄像头拍下了这几天这个路口发生的一切情况，然后经过和井上手里拿到的图片自己对比，虽然经过伪装，但是在职业特工眼里这些都是小把戏。很快凌波，杨阳，姚明三人便显现出来，然后马上联络日本进出境管理中心开始进行识别，经过一番甄别之后，三张更为清晰的照片放到了井上明手中，而且以此同时照片已经发送到日本在亚洲所有国家潜伏的情报人员那里，完成这一切的井上明知道，一切就快水落石出了。
而这时的美国，一架从涂着USAF的直升机在沙箱基地降落了，三个身穿研究服的人抬着一个箱子从直升机下来了，然后径直走进机场跑道旁边外表破旧的大楼里面，然后开始在严密防护措施下进行身份认证。三人里面走在最前面的一名研究人员拿出一份文件递给荷枪实弹的检查人员，检查人员仔细检查核实文件之后，带领他们来到通往地下的电梯前，三人首先刷入包含自己身份证明的通行卡，然后进行面部识别，一切通过之后三人和一个标注机密的箱子进入了电梯，很快便来到了位于地下五层的研究所中心大厅，来到大厅之后没有丝毫停顿来到了标识着公共设备检修的房间门口，然后看周围没有异常之后快速刷卡进入。
进入房间之后三人打开了箱子，然后从箱子里面分别拿出了两个小型手提箱，然后三人面对面的这么看着，这时突然一句中国话冒了出来“要是早有这玩意，咱们之前的工作可就和探囊取物一般啊，老姚啊，你再不提升专业技能的话，老子下次就不带你出来玩了”杨阳的声音传了出来，然后一边摸摸自己的脸一边继续说“你别说，这东西还真好使，我真还以为这东西只是阿汤哥御用的”，很显然，刚才进来的三人小组就是凌波他们，他们已经完成了任务的第一步，进入了这个不存在的沙箱基地，通过的层层检测不仅有着已经准备好的资料还有这个戴在三人头上的面具。凌波这时可没有闲工夫听杨阳闲扯“别废话了，时间有限，现在对表，倒计时五十分钟”。设置好时间之后，杨阳从箱子里拿出电脑和工具，走到墙角蹲了下来，打开了附在墙上的一个金属网格，然后用工具打开了里面的一个金属盒，将自己的电脑连了上去，然后凌波和姚明将耳机塞入耳朵带上和研究所内其他研究人员一样的防毒面具走出了房门。
当凌波成功渗透了沙箱基地之后，远在日本的井上明也回到了内阁情报调查室，这时凌波他们的资料已经传了过来，难道日本情报部门的效率就这么高吗？现在就介绍一下这个号称日本最高的情报机构吧。
内阁情报调查室，直属内阁官房长官领导。情报调查室负责人---内閣情報官每周要与内阁官房长官碰面一次，对日本政府的重大决策的国内外反应、国际上重大政治经济情报、国内形势、舆论导向等重要情报向内阁官房长官进行一次工作汇报，如有重大突发事件的，调查室长官可以随时向内阁官房长官乃至直接向首相汇报。
“内科情报调查室”负责人原来称室長，2001年改称为内閣情報官，他的副手称内閣審議官，再下面还有`八大金刚`，即设有`内閣情報調査室調査官`八个职位。另外还设有内閣参事官、内閣事務官等职位，这些职位的任职人数有弹性，并可以聘用兼职者。有时根据形势需要，还可以聘用大学教授，专家等人做兼职。但总体来看职员警察出身的比较多。
现有所属職員約170人（包括兼职者）。内勤約70人、常驻外派的有，警察庁約40人、公安調査庁約20人、防衛庁約10人、另外，外務省、総務省、消防庁、海上保安庁、財務省、経済産業省等各有数名。2001年4月新设内阁卫星情报搜集中心，编制人员约190名。另外在日本南、北端还分别设有(北海道)苫小牧卫星情报中心、(鹿儿岛)阿久根卫星情报中心等南、北地面局各一处，以弥补主地面局涵盖面积不足。整个中心若包含地面局人员，总数在320人左右。