忍者联军部队：
领导层
首脑：火影秋道丁武、土影两天秤大野木、风影我爱罗、水影照美冥、雷影艾和铁之国首领三船
最高统帅：五代火影秋道丁武
总参谋：四代雷影、千手纲手
参谋：奈良鹿久、麻布依
联军总队长（统领忍者联军）：风影我爱罗
特别部队：
感知部队：（负责感知敌人方位）
感知部队队长：青
已知成员：西
情报部队：（负责传送情报）
情报部队队长：山中亥一
已知成员：山城青叶、天画
负责接收、传达各处情报的部队
木叶侦察小队：（负责寻找兜的所在地）
队长：御手洗红豆
已知成员：油女牟田、日向德间、岚华
医疗后勤部队：（负责救助伤员）
队长：静音
已知成员：春野樱、卯月夕颜
大名护卫队：（为保护大名而成立的特殊部队）
统领：五代水影·照美冥
已知成员：长十郎、不知火玄间、并足雷同
奇袭部队：（试探敌人）
队长：勘九郎
已知成员：奥摩伊、佐井、逸段、日向火炼徒、段吾、左治、桐
战斗部队：
第一部队：中距离联合军分队（主力为擅长暗器和武器的忍者）
统领：达鲁伊
已知成员：天天、秋道丁座、日向日足、萨姆依、阿赤伊、钢子铁、神月出云
第二部队：近战联合军分队（负责斩杀数量多的敌人，战斗在最前线的队伍）
统领：黄土
已知成员：黑土、日向宁次、卡茹依、日向雏田
第三部队：战斗近中距离联合军分队（负责持久战，只有兼备体力和速度的忍者才能胜任）
统领：旗木卡卡西
已知成员：凯、李洛克、山中三田、奈良盐水、真树
第四部队：远距离战斗联合军分队（同时负责支援前线及后方的部队）
统领：我爱罗
代理统领：奈良鹿丸
已知成员：手鞠、秋道丁次
第五部队：战斗特别部队（全为武士，使用特殊忍术及战斗方法的部队）
统领：三船
已知成员：油女志乃、犬冢牙、山中井野、犬冢花
晓组织：
领导层
首脑：
前期：宇智波带土、药师兜
中期：宇智波带土、宇智波斑
后期：大筒木辉夜
幕后主谋：黑绝
战斗部队：十万白绝、由外道魔像制造出来的十万个白绝，分布于各个战场
秽土转生部队
晓前成员：长门、迪达拉、角都
前任人柱力：二位由木人、矢仓、老紫、樊、羽高、芙
血继限界忍者：狩、叶仓、特洛伊、帕库拉、
已故的名将：山椒鱼半藏、千代婆婆、加藤断、金角、银角、信、中吉、月光疾风、油女取根
前任“忍刀七人众：西瓜山河豚鬼、栗霰串丸、通草野饵人、无梨甚八、林檎雨由利、鬼灯满月
五大国各影：二代土影·无、二代水影、三代雷影、四代风影
而目前的形势看是忍者联军方面的强者多一些。
有五位影（秋道武、照美冥、我爱罗、两天枰大野木、艾）、奇拉比、鸣人、黄土、三船、三代火影、水门、纲手、自来也、玖辛奈、宇智波富岳、止水、鼬、佐助、赤砂之蝎、飞段、再不斩、君麻吕、日向日足、日向日差、旗木朔茂、卡卡西、迈克刚、迈克凯、猿飞新之助、白、鞍马八云、雏田、小楠、宁次、丁次、鹿丸、小李等等。